Кисень не токсичний. Граничнодопустима концентрація не нормується.
При потраплянні на шкіру рідкий кисень викликає опіки. Тривала інгаляція газоподібного кисню при нормальному тиску викликає поразку органів дихання та легенів. При підвищеному тиску - викликає поразку центральної нервової системи.
Ознаки й симптоми, що спостерігаються при атмосферному тиску: почуття стиснення у грудях, тахікардія, блювота, розвиток бронхіту або пневмонії. При підвищеному тиску розвиваються симптоми досудорожного періоду (утруднення дихання, головокружіння, нудота, блювота, розширення зіниць, зменшення гостроти зору, дзвін у вухах). При продовженні дії при підвищеному тиску наступає судорожний період: втрата свідомості з появою судорог генералізованного характеру. Обмороження шкіри й поразка слизуватої оболонки ока.
На довкілля не шкідливо впливає. Міститься в повітрі, воді та грунті. Бере учать в круговороті речовин у природі. Чинить токсичний вплив на риб.